PDFファイルはダウンロード版にも付属しますか？

もちろん、ダウンロード版にも付属します。
DVD版ではDVD内に同梱（視聴にはパソコンが必要です）、ダウンロード版は本編動画と一緒に「MY PAGE」内の「ダウンロード」からダウンロードして頂けます。